Protein–RNA interactions for Protein: Q08351

Mpl, Thrombopoietin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MplQ08351 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MplQ08351 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MplQ08351 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MplQ08351 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MplQ08351 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MplQ08351 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MplQ08351 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MplQ08351 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MplQ08351 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MplQ08351 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MplQ08351 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MplQ08351 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MplQ08351 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MplQ08351 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MplQ08351 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MplQ08351 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MplQ08351 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MplQ08351 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MplQ08351 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MplQ08351 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MplQ08351 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MplQ08351 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MplQ08351 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MplQ08351 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MplQ08351 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MplQ08351 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MplQ08351 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MplQ08351 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MplQ08351 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MplQ08351 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MplQ08351 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MplQ08351 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MplQ08351 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MplQ08351 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MplQ08351 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MplQ08351 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MplQ08351 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MplQ08351 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MplQ08351 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MplQ08351 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MplQ08351 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MplQ08351 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MplQ08351 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MplQ08351 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MplQ08351 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MplQ08351 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MplQ08351 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MplQ08351 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MplQ08351 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MplQ08351 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MplQ08351 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MplQ08351 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MplQ08351 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MplQ08351 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MplQ08351 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MplQ08351 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MplQ08351 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MplQ08351 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MplQ08351 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MplQ08351 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MplQ08351 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms