Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CbfbQ08024 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CbfbQ08024 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CbfbQ08024 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CbfbQ08024 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms