Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntn3Q07409 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn3Q07409 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn3Q07409 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntn3Q07409 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms