Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah2Q06986 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah2Q06986 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah2Q06986 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms