Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Runx1Q03347 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Runx1Q03347 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Runx1Q03347 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms