Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SeleQ00690 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SeleQ00690 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeleQ00690 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SeleQ00690 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SeleQ00690 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeleQ00690 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SeleQ00690 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SeleQ00690 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SeleQ00690 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms