Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gjb6P70689 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gjb6P70689 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gjb6P70689 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gjb6P70689 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms