Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plxna3P70208 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxna3P70208 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxna3P70208 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plxna3P70208 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxna3P70208 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms