Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crabp1P62965 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Crabp1P62965 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Crabp1P62965 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Crabp1P62965 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms