Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx1P62960 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ybx1P62960 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ybx1P62960 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ybx1P62960 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ybx1P62960 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms