Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl39P62892 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl39P62892 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms