Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Csrnp3P59055 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Csrnp3P59055 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Csrnp3P59055 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Csrnp3P59055 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Csrnp3P59055 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms