Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a3P56564 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a3P56564 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a3P56564 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a3P56564 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a3P56564 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a3P56564 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc1a3P56564 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc1a3P56564 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms