Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf5P56477 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irf5P56477 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irf5P56477 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf5P56477 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Irf5P56477 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Irf5P56477 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Irf5P56477 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Irf5P56477 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf5P56477 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms