Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc2P55292 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dsc2P55292 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc2P55292 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms