Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms