Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrp3P50462 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrp3P50462 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csrp3P50462 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csrp3P50462 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms