Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptx3P48759 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptx3P48759 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptx3P48759 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms