Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx2P48379 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx2P48379 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfx2P48379 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms