Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epb41P48193 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epb41P48193 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epb41P48193 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Epb41P48193 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epb41P48193 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41P48193 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epb41P48193 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41P48193 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41P48193 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41P48193 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41P48193 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41P48193 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41P48193 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms