Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PfkmP47857 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PfkmP47857 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PfkmP47857 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PfkmP47857 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PfkmP47857 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PfkmP47857 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PfkmP47857 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PfkmP47857 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PfkmP47857 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfkmP47857 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfkmP47857 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfkmP47857 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PfkmP47857 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PfkmP47857 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms