Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo1bP46735 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo1bP46735 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo1bP46735 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Myo1bP46735 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Myo1bP46735 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.2 ms