Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tjp1P39447 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tjp1P39447 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tjp1P39447 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tjp1P39447 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Tjp1P39447 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tjp1P39447 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tjp1P39447 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms