Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sar1aP36536 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sar1aP36536 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sar1aP36536 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sar1aP36536 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sar1aP36536 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms