Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VtnP29788 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VtnP29788 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VtnP29788 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VtnP29788 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VtnP29788 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VtnP29788 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VtnP29788 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VtnP29788 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VtnP29788 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VtnP29788 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VtnP29788 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VtnP29788 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VtnP29788 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VtnP29788 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VtnP29788 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VtnP29788 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VtnP29788 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VtnP29788 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VtnP29788 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VtnP29788 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VtnP29788 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VtnP29788 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VtnP29788 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VtnP29788 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VtnP29788 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VtnP29788 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VtnP29788 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VtnP29788 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VtnP29788 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VtnP29788 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VtnP29788 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VtnP29788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VtnP29788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VtnP29788 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VtnP29788 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VtnP29788 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VtnP29788 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VtnP29788 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VtnP29788 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VtnP29788 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VtnP29788 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VtnP29788 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VtnP29788 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VtnP29788 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VtnP29788 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VtnP29788 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VtnP29788 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VtnP29788 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VtnP29788 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms