Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NdnP25233 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NdnP25233 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NdnP25233 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NdnP25233 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NdnP25233 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NdnP25233 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NdnP25233 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NdnP25233 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NdnP25233 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NdnP25233 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NdnP25233 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NdnP25233 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NdnP25233 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NdnP25233 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NdnP25233 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NdnP25233 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NdnP25233 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NdnP25233 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NdnP25233 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NdnP25233 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NdnP25233 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NdnP25233 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NdnP25233 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NdnP25233 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NdnP25233 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NdnP25233 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NdnP25233 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NdnP25233 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NdnP25233 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NdnP25233 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NdnP25233 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NdnP25233 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NdnP25233 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NdnP25233 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NdnP25233 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NdnP25233 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NdnP25233 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NdnP25233 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NdnP25233 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NdnP25233 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NdnP25233 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NdnP25233 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NdnP25233 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NdnP25233 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NdnP25233 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NdnP25233 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NdnP25233 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NdnP25233 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NdnP25233 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms