Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cdk11bP24788 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk11bP24788 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cdk11bP24788 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cdk11bP24788 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdk11bP24788 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cdk11bP24788 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms