Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ms4a2P20490 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ms4a2P20490 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ms4a2P20490 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ms4a2P20490 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms