Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fcer1aP20489 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fcer1aP20489 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fcer1aP20489 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fcer1aP20489 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms