Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms