Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18528 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18528 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18528 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18528 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18528 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18528 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18528 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18528 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18528 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18528 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18528 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18528 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18528 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18528 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18528 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18528 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18528 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18528 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18528 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18528 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
P18528 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18528 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18528 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18528 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18528 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18528 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18528 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18528 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18528 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18528 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18528 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18528 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18528 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18528 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18528 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18528 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18528 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18528 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18528 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18528 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18528 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P18528 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18528 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18528 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18528 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18528 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18528 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18528 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18528 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18528 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18528 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18528 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18528 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18528 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18528 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms