Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chrm1P12657 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm1P12657 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm1P12657 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrm1P12657 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms