Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcp1P11983 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcp1P11983 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcp1P11983 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms