Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdk1P11440 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk1P11440 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk1P11440 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk1P11440 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms