Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa5P09021 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa5P09021 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms