Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gap43P06837 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gap43P06837 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gap43P06837 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gap43P06837 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gap43P06837 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gap43P06837 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gap43P06837 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gap43P06837 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gap43P06837 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gap43P06837 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gap43P06837 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gap43P06837 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms