Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P01669 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01669 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01669 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01669 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01669 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01669 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01669 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01669 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01669 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01669 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01669 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01669 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01669 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01669 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01669 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01669 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01669 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01669 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01669 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01669 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01669 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01669 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01669 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01669 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01669 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01669 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P01669 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01669 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01669 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P01669 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01669 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01669 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01669 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01669 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01669 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01669 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01669 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01669 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01669 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01669 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01669 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01669 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01669 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01669 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01669 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01669 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01669 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01669 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01669 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01669 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01669 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01669 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01669 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01669 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01669 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01669 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01669 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01669 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01669 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01669 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P01669 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P01669 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01669 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01669 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01669 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms