Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Parp2O88554 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp2O88554 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Parp2O88554 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Parp2O88554 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Parp2O88554 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Parp2O88554 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Parp2O88554 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Parp2O88554 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms