Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dll3O88516 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dll3O88516 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dll3O88516 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dll3O88516 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dll3O88516 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dll3O88516 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms