Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lnx1O70263 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lnx1O70263 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lnx1O70263 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lnx1O70263 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lnx1O70263 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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