Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sigmar1O55242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sigmar1O55242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sigmar1O55242 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sigmar1O55242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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