Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad51dO55230 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rad51dO55230 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rad51dO55230 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms