Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eif6O55135 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Eif6O55135 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif6O55135 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Eif6O55135 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Eif6O55135 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Eif6O55135 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Eif6O55135 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Eif6O55135 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Eif6O55135 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif6O55135 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif6O55135 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Eif6O55135 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif6O55135 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif6O55135 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Eif6O55135 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Eif6O55135 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Eif6O55135 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif6O55135 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif6O55135 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eif6O55135 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif6O55135 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif6O55135 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif6O55135 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms