Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr2O55101 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syngr2O55101 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr2O55101 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms