Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb10O35955 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psmb10O35955 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psmb10O35955 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb10O35955 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms