Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Socs1O35716 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Socs1O35716 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Socs1O35716 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Socs1O35716 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Socs1O35716 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Socs1O35716 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Socs1O35716 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms