Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PnnO35691 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PnnO35691 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PnnO35691 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PnnO35691 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PnnO35691 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PnnO35691 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PnnO35691 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PnnO35691 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PnnO35691 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PnnO35691 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PnnO35691 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PnnO35691 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PnnO35691 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PnnO35691 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PnnO35691 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PnnO35691 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PnnO35691 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PnnO35691 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PnnO35691 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PnnO35691 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PnnO35691 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PnnO35691 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PnnO35691 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PnnO35691 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PnnO35691 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PnnO35691 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PnnO35691 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PnnO35691 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PnnO35691 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PnnO35691 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PnnO35691 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PnnO35691 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PnnO35691 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PnnO35691 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PnnO35691 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PnnO35691 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PnnO35691 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PnnO35691 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PnnO35691 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PnnO35691 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PnnO35691 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PnnO35691 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PnnO35691 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PnnO35691 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PnnO35691 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PnnO35691 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PnnO35691 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PnnO35691 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PnnO35691 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PnnO35691 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PnnO35691 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PnnO35691 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PnnO35691 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PnnO35691 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PnnO35691 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PnnO35691 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PnnO35691 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PnnO35691 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PnnO35691 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PnnO35691 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PnnO35691 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PnnO35691 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PnnO35691 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PnnO35691 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PnnO35691 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PnnO35691 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PnnO35691 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PnnO35691 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PnnO35691 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PnnO35691 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PnnO35691 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PnnO35691 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PnnO35691 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms