Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rabep1O35551 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rabep1O35551 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rabep1O35551 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rabep1O35551 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rabep1O35551 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rabep1O35551 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rabep1O35551 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rabep1O35551 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rabep1O35551 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rabep1O35551 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rabep1O35551 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rabep1O35551 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rabep1O35551 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rabep1O35551 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabep1O35551 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms