Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efnb3O35393 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efnb3O35393 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb3O35393 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms