Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn2r89O35199 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn2r89O35199 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r89O35199 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms