Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q1O19441 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-Q1O19441 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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H2-Q1O19441 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-Q1O19441 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-Q1O19441 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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